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安徽快三破解安卓版:担心NGS文库构建样本量不够?小达君帮您轻松搞定!

作者:admin 信息来源:达科为 日期:20190610 打印 字体:  
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想要文章高大上,基因测序来帮忙!

文库构建难,难!难?

选对试剂,一切都不是事儿!”

小达君暖心推荐Diagenode低样本量文库构建试剂盒,让小样本量的基因测序也成为可能!下面,我们就来看看这款试剂盒到底有多优秀吧。

 

The MicroPlex Library PreparationTM Kit v2


? 单管操作,只需3步,2小时完成;

? Input只需pg级别;

? 减少潜在的bias——更少的PCR扩增反应;

? 高灵敏度的ChIP-seq——PCR重复率低;

高通量的灵活性,含有48 barcodes(8 nt);

? 可自动化操作

 简单快速的操作流程


Fig.1 比较MicroPlex kit和Illumina? TruSeq? kit构建文库的操作流程

MicroPlex ki只需要一次纯化,三步即可完成。而Illumina?的工作流程需要纯化多次,经过5步才能完成。

 

只需少量起始样本量—— 50pg DNA


Fig.2 片段化的dsDNA, input范围从50pg至50ng,通过快速简单的3-step protocol,在Illumina?NGS平台制备测序文库。扩增纯化后的文库用于测序。Kit里面的indexing试剂,可在每条测序通道进行12个样本的测序。

 

从少量起始样本中获得高品质的测序数据


Fig.3  对ChIP-seq富集产物的可靠检测,并与ChIP-seq参考数据完美匹配。

A、用Diagenode的H3K4me3抗体、True MicroChIP Kit进行ChIP实验,10000个细胞中ChIP下来17pg DNA,对照组35pg DNA。IP下来的DNA用MicroPlex Library Preparation Kit扩增并被转化为可用于Illumina?平台测序的文库,通过IlluminaR Genome Analyzer分析文库,根据说明书进行簇生成和测序。

B、观察到前40%的ChIP peaks与参考dataset间完美匹配?;贜IH Encode项目规范,如果前40%的peaks与对比dataset有至少80%的重叠比例,ChIP-seq 的结果被认为是original 和reproduced dataset间有重合性。

 品牌简介

Diagenode公司2003年成立于比利时,是世界上生产表观遗传学产品的知名公司。其产品包括声波破碎机(Bioruptor?),自动化系统(IP-Star?),染色质免疫沉淀反应(ChIP)和DNA甲基化分析,高质量的抗体,是表观遗传学、生物样本制备和诊断的完整表观遗传学解决方案的领先供应商。

产品信息

产品货号

产品名称

规格

品牌

C05010012

MicroPlex Library Preparation kit v2 x12 (12 indices)  

12 rxns

Diagenode

C05010013

MicroPlex Library Preparation kit v2 x 48 (12 indices)  

48 rxns

C05010014

MicroPlex Library Preparation kit v2 x 48 (48 indices)  

48 rxns

C01010131

True MicroChIP & MicroPlex Library Preparation Package  

16 ChIP rxns and 12 library prep rxns


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